Den (ikke) sædvanlige mistanke om roman-koronavirus med flagermus-oprindelse

cmjis 4 infografik 13. feb 2020
cmjis 4 infografik 13. feb 2020

A nyere undersøgelse identificerer og roman coronavirus, der er ansvarlig for lungebetændelsesepidemien i Hubei-provinsen i Kina—Bat-origin virus er relateret til andre kendte patogene coronavirus

2019 roman coronavirus (CoV) forårsager dødelig lungebetændelse, der har kostet over 1300 menneskeliv, med mere end 52000 bekræftede tilfælde af infektion med 13. februar 2020, alt sammen i løbet af lidt over en måned. Men hvad er denne virus? Er det en ny virus helt? Hvor kom det fra? Forskere fra topforskningsinstitutter i Kina gik sammen for at besvare disse spørgsmål, og denne banebrydende undersøgelse er blevet offentliggjort i Kinesisk medicinsk tidsskrift.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

I begyndelsen af ​​december begyndte nogle få mennesker i byen Wuhan i Hubei-provinsen i Kina at blive syge efter at have været på et lokalt fiskemarked. De oplevede symptomer som hoste, feber og åndenød og endda komplikationer relateret til akut respiratorisk nødsyndrom (ARDS). Den øjeblikkelige diagnose var lungebetændelse, men den nøjagtige årsag var uforklarlig. Hvad forårsagede dette nye udbrud? Er det det alvorlige akutte respiratoriske syndrom (SARS) -CoV? Er det respiratorisk syndrom i Mellemøsten (MERS) -CoV? Som det viser sig, havde forskere foretaget en undersøgelse for at identificere denne virus i december efter at have analyseret de første par tilfælde. Denne undersøgelse er nu offentliggjort i Kinesisk medicinsk tidsskrift og virusets identitet er blevet fastslået — det er en helt ny virus, tæt knyttet til flagermus-SARS-lignende CoV. Dr. Jianwei Wang (Chinese Academy of Medical Sciences, Institute of Pathogen Biology), ledende forsker i undersøgelsen, udtaler:Vores papir har fastslået identiteten af ​​flagermus-oprindelsen CoV, der indtil videre var ukendt."

I denne undersøgelse opdagede og identificerede forskere fra kendte forskningsinstitutter i Kina, såsom det kinesiske akademi for medicinske videnskaber, Institute of Pathogen Biology, China-Japan Friendship Hospital og Peking Union Medical College den nye CoV - den største skyld i Wuhan-udbruddet - ved næste generations sekventering (NGS). De fokuserede på fem patienter indlagt på Jin Yin-tan Hospital i Wuhan, hvoraf de fleste var arbejdere på Huanan Seafood Market i Wuhan. Disse patienter havde høj feber, hoste og andre symptomer og blev oprindeligt diagnosticeret med lungebetændelse, men af ​​en ukendt årsag. Nogle patienters tilstand forværredes hurtigt til ARDS; en døde endda. Dr. Wang siger, ”Røntgenstråler fra brystet fra patienterne viste nogle uklare opaciteter og konsolideringer, som er typiske for lungebetændelse. Vi ønskede imidlertid at finde ud af, hvad der forårsagede lungebetændelsen, og vores efterfølgende eksperimenter afslørede den nøjagtige årsag—En ny CoV, der ikke var kendt før."

Til undersøgelsen brugte forskerne bronchoalveolar lavage (BAL) væskeprøver taget fra patienterne (BAL er en procedure, hvor steril væske overføres til lungerne gennem et bronkoskop og derefter indsamles til analyse).

For det første forsøgte forskerne at identificere virussen ved genomsekventering ved hjælp af NGS-teknologi. NGS er den foretrukne screeningsmetode til identifikation af ukendte patogener, fordi den hurtigt detekterer og udelukker alle kendte patogene mikroorganismer i prøven. Baseret på sekventering af DNA / RNA fra BAL-væskeprøverne fandt forskerne, at de fleste af viralavlæsningerne tilhørte CoV-familien. Forskerne samlede derefter de forskellige "læser", der tilhørte CoV'er, og konstruerede en hel genomisk sekvens til den nye virus; disse sekvenser var 99.8-99.9% ens blandt alle patienternes prøver, hvilket bekræftede, at denne virus var det almindelige patogen hos alle patienter. Ved hjælp af homologianalyse, hvor en genom-sekvens sammenlignes med andre kendte genom-sekvenser (med en forudindstillet tærskel på 90% for at den kan betragtes som en "ny" sekvens), bekræftede de yderligere, at genom-sekvensen for denne nye virus er 79.0% svarende til SARS-CoV, ca. 51.8% svarende til MERS-CoV, og ca. 87.6–87.7% svarende til andre SARS-lignende COV'er fra kinesiske hestesko-flagermus (kaldet ZC45 og ZXC21). Fylogenetisk analyse viste, at sekvenserne af de fem opnåede CoV-stammer var tættest på sekvenser for bat-afledte stammer, men dannede separate evolutionære grene. Disse fund tyder tydeligt på, at virussen stammer fra flagermus. Dr. Wang siger, ”Da lighederne mellem det virale replikasegen og alle andre kendte "lignende" vira stadig er mindre end 90%, og også under hensyntagen til de fylogenetiske analyseresultater, mener vi, at dette faktisk er en ny, tidligere ukendt CoV. Denne nye virus kaldes midlertidigt 2019-ncov."

Endelig bevægede forskerne sig til at "isolere" virussen fra BAL-væskeprøverne ved at kontrollere, om væskeprøverne viste cytopatisk virkning på cellelinier i laboratoriet. Cellerne udsat for væskeprøverne blev observeret under et elektronmikroskop, og forskerne fandt karakteristiske CoV-lignende strukturer. De brugte også immunfluorescens - en teknik, der bruger specifikke antistoffer mærket med fluorescerende farvestoffer. Til dette brugte de serum fra de inddrivende patienter (som indeholdt antistoffer), som reagerede med de virale partikler inde i cellerne; dette bekræftede, at denne virus faktisk var årsagen til infektionen.

Denne undersøgelse baner vejen for fremtidige studier for bedre at forstå virussen og dens kilder, især i betragtning af dens hurtige spredning, dens evne til at forårsage fatal ARDS og panikken forårsaget af udbruddet. Selvom 4 af de 5 patienter, som denne virus blev identificeret fra, kom fra et marked for fisk og skaldyr i Wuhan, er den nøjagtige oprindelse for infektion ukendt. CoV kunne have været overført til mennesker gennem en "mellemliggende" bærer, såsom i tilfælde af SARS-CoV (palmecivetkød) eller MERS-CoV (kamel). Dr. Wang konkluderer, ”Alle humane CoV'er er zoonotiske, og flere humane CoV'er stammer fra flagermus, herunder SARS- og MERS-CoVs. Vores undersøgelse viser tydeligt det presserende behov for regelmæssig overvågning af overførslen af ​​bat-origin CoV'er til mennesker. Fremkomsten af ​​denne virus er en massiv trussel mod folkesundheden, og derfor er det af afgørende betydning at forstå kilden til denne virus og beslutte de næste skridt, inden vi bliver vidne til et større udbrud".

Om forfatteren

Avatar af Syndicated Content Editor

Syndikeret indholdseditor

Del til...