Myndighederne bad tusinder af mennesker i det nordøstlige Japan om at evakuere deres hjem søndag, da kraftig regn forårsagede store oversvømmelser og skar nogle jernbaneforbindelser.
Stormen følger uklar regn i det sydvestlige Japan tidligere på denne måned, der efterlod mindst 25 mennesker døde.
Næsten 25,000 mennesker i Akita-præfekturet fik ordre til at evakuere, og omkring 65,000 flere blev rådgivet til at forlade eller fik besked på at forberede sig på at forlade området, sagde en embedsmand ved Akita-præfekturet.
Nogle kugletog, der kører til og fra Akita, er blevet suspenderet på grund af de kraftige regnvejr, sagde East Japan Railway på sin hjemmeside.